Лечение на Иссык-куле предлагают ряд санаториев находящихся на южном и северном берегах озера. Отдых и лечение на Иссык-куле, туристы совмещают круглогодично, так как все санатории,  продолжают свою работу и после основного летнего сезона, таким образом на лечение на озере Иссык-куль, можно приехать в любой месяц года. Но разумеется что лучше всего побывать на озере, в летний купальный сезон, который начинается в конце мая и может продолжаться до середины сентября.Очень часто бывают периоды когда погода на Иссык-куле, в первый месяц осени стоит теплая, солнечная, и температура воды позволяет комфортно купаться до конца сентября. Поэтому для того чтобы была полноценная возможность принимать солнечные, и воздушные ванны, а так же купаться в комфортной  по температуре для организма воде, как мы уже предлагали выше, лучше приехать на отдых и лечение на Иссык-куле в летний куротно-санаторный сезон, с мая по сентябрь. А для тех, кому купание и загар не принципиальны, для тех, кому больше по душе тишина и покой, которые резко контрастируют с  шумным неугомонным летним периодом, рекомендуем приехать в межсезонье.  В  пользу этого периода можно привести, несколько положительных моментов, прежде всего, одним из преимуществ отдыха и лечения на Иссык-куле в это время, будет существенно сниженные цены, по сравнению с летом,  так же можно отметить, как положительную сторону, отсутствие длинных очередей в процедурных кабинетах, грязе и водолечебницах, в следствии чего у медицинского персонала, будет больше времени, уделить внимание, своим пациентам. Южный берег на озере Иссык-куль, предлагает остановиться в военном санатории Тамга. Прекрасная дикая природа Юга, неотразимые по красоте горные пейзажи, синие волны Иссык-куля,  тихая и уютная атмосфера в санатории, сразу же располагают к спокойствию и приятному времяпрепровождению на отдыхе. Лечение в санатории Тамга, проводится под пристальным наблюдением врачей, имеющих долгий опыт работы в этом направлении. Врачи в области курортологии в санатории Тамга, так же имеют хороший опыт работы, и в области спортивной медицины. Еще в советское время в санатории, проходили реабилитацию многие спортсмены, прославившие СССР на престижных международных соревнованиях. Так же в горах Юга в поселке Джеты-Огуз, расположен одноименный курорт. В переводе с киргизского языка это словосочетание означает семь быков. Так местные жители назвали этот горный район по причине того, что его скалы похожи на головы быков, застывших в камне. Трудно передать на словах, ту прелесть и красоту, которые окружают курорт Джетыогуз. Тянь-Шаньские ели спускаются с обрывов, и образуют изумрудную чащу, вдоль которой несет в  свои прозрачные воды в озеро Иссык-куль бурная горная река. Здесь на курорте Джеты-Огуз, проходили предполетную подготовку в космические полеты, летчики-космонавты СССР, среди которых был первый  в мире человек, покоритель комического океана Юрий Гагарин.

В северной части озера так же расположены санатории, которые предлагают лечение на Иссык-куле круглый год. Это старейшие здравницы, которые начали свою деятельность, много лет тому назад и давно зарекомендовали себя как курортно-санаторные комплексы, предлагающие туристам отдых и лечение на озере Иссык-куль. Кратко представить эти санатории можно по их месторасположению с запада но восток, по маршруту Бишкек- Каракол севером. Первый санаторий по пути следования это Госрезиденция№2 г.Чолпон-Ата. Этот санаторий находится в центральной части курортного городка, в прибрежной зоне. В санатории большая,  в несколько десятков гектаров территория, с собственным пляжем. Туристы отдыхающие в санатории, могут получить лечение сердечных болезней, осложнений связанных с опорно-двигательным аппаратом, желудочных болезней, и ряда других. В санатории Госрезиденция№2, хорошая медицинская база, для проведения различных процедур. Лечение проводят высококлассные специалисты с многолетним стажем. На лечение и отдых в санатории Госрезиденция№2 останавливались экс-президенты некоторых стран, и оставляли самые положительные отзывы о здравнице. Вторым санаторием в городе Чолпон-Ата, является санаторий Голубой Иссык-куль, это самый  популярный у жителей Республики санаторный комплекс, работающий более полувека, в котором за время его деятельности,  отдыхали и получали лечение, свыше миллиона отдыхающих. В санатории Голубой Иссык-куль, можно получать лечение в любой месяц года. Современная медицинская база санатория, осуществляет лечение и профилактику многих болезней. Врачи работающие в Голубом Иссык-куле, имеют высокую квалификацию, и постоянно работают над ее повышением. Рядом с санаторием расположено много пансионатов и отелей, ближайший сосед санатория, это дом отдыха Чолпон-ата, отдыхающие которого, пользуясь удобным месторасположением, посещают процедурные кабинеты и водолечебницу здравницы. Центральная часть городской инфраструктуры Чолпон-Аты, находится в непосредственной близости от санатория. Отдыхающие могут посетить восточные базары, где прилавки ломятся от обилия ягод и фруктов, продовольственные магазины, с широким ассортиментом продукции, достопримечательности города, или отправиться на экскурсию от автовокзала в любой уголок Иссык-кульской области. Отдых на Иссык-куле в санатории Голубой Иссык-куль, позволяет полноценно провести отпуск, и позаботиться о здоровье своего организма. Далее на восток по северу Иссык-куля в самом начале села Бостери, предлагает свои услуги санаторий Казахстан. Этот санаторий начал работать в советское время. Это был тот счастливый период развитого социализма, когда в единой дружной стране, любой хозяйствующий субъект, любая организация страны, независимо от ее места расположения, от Камчатки до Калининграда, от Мурманска до Кушки, имела возможность строить свои здравницы на Иссык-куле, впрочем как и на других курортах Советского союза, тем самым  на деле, претворяя в жизнь законное право трудящихся, на отдых. Те старые добрые времена, к сожалению безвозвратно ушли, многое изменив, не всегда в лучшую сторону, но санаторий Казахстан, по прежнему остается в ведении Казахской Республики, как напоминание  о великой нерушимой дружбе народов Советской страны, предлагая отдых и лечение на Иссык-куле. На сегодняшний день все здравницы работают круглый год, и принимают  пациентов из любого региона. Туристы могут выбрать понравившееся место отдыха, предварительно забронировав период пребывания и категорию номера по телефону или по интернету, и в указанное время, в санатории будут ожидать их прибытия. В каждом курортном комплексе помимо лечения, могут быть организованы культурные программы, которые включают в себя экскурсии по знаковым местам побережья. Это довольно интересные мероприятия которые помогают лучше узнать одну из республик Средней Азии.

На постоянной основе в здравницах можно записаться на туры, которые проходят по маршрутам Великого шелкового пути, в Иссык-кульской области. Здесь много мест, которые стоит осмотреть,      

В центре курортного поселка Бостери где самое большое скопление здравниц, особняком выделяется санаторий Кыргызское взморье. Данный санаторий самый крупный и популярный  курортный объект села Бостери. Можно сказать, что вся курортная жизнь поселка проходит вокруг этого санатория, и он является сам по себе, достопримечательностью этого района, с прекрасно обустроенной инфраструктурой. В санатории Киргизское взморье огромная просторная территория, с самым большим  на все побережье пляжем. На всей площади которую занимает санаторий, произрастают в множественном количестве, деревья и кустарники, которые образуют сплошную парковую зону, начиная от арки санатория и заканчивая выходом к санитарной зоне собственного пляжа. На отдых и лечение на Иссык-куле, в санаторий Киргизское взморье приезжают туристы со всех уголков Киргизии и  ближайших соседних стран-Республик. Так же санаторий Кыргызское взморье широко известен во многих регионах России. Сюда для лечения на Иссык-куле, приезжают отдыхающие из Сибирских регионов, и центральной части Российской Федерации.  В санатории отдыхающие получают медицинские процедуры по таким показаниям как бронхиальная астма, болезни легких не связанных с туберкулезом, люди с проблемами кишечно-желудочного тракта, опорно-двигательной системы, многих сердечных заболеваний, дерматологических и других.  В бывшем селе Комсомол, которое ныне называется Булан-Соготуу,  находится известный далеко за пределами Кыргызстана, санаторий Аврора. Здание санатория, построено в 1979 году, и его архитектурный ансамбль, является прообразом того «Белого парохода» из одноименного произведения, известного на весь мир, советского, киргизского, писателя и мыслителя Ч.Т.Айтматова. Строгие и стремительные очертания санатория, на фоне озера цвета ультрамарин и яркого ослепительного солнца, уже только своим видом, создают великолепную картину поднимающую настроение, и являются своеобразной ландшафтотерапией.  Зеленая бережно ухоженная территория санатория, удивительно сочетается с горными просторами северного побережья. В санатории Аврора Иссык-куль, одна из лучших медицинских баз, оснащенная зарубежным оборудованием, которое давно и успешно зарекомендовало себя в области курортологии.  Врачи санатория,  проводят диагностическое исследование, которое включает в себя лабораторные тесты по многим показаниям,  проведут функциональную диагностику организма, предложат курс бальнеологического лечения,  физиотерапии, грязелечения, водных процедур, лечебной физкультуры, и других методов оздоровления.                                          

В восточной части озера в районе города Каракол, расположено несколько лечебниц которые находятся на удалении от береговой линии, это курорты Алтын-Арашан, Джергалан. Туристы на этих курортах проходят курсы оздоровления лечебными водами из собственных термальных и минеральных источников, есть ряд оздоровительных программ, которые проводятся на открытом воздухе. Особенно рекомендованы предлагаемые здравницами процедуры, людям страдающим заболеваниями опорно-двигательного аппарата, а также больным проходящим реабилитацию после различных травм. Врачами здравниц за многолетнюю работу, накоплен огромный опыт, освоены передовые методы лечения, успешно применяются собственные наработки и методики, в лечении и профилактике многих заболеваний. Нельзя не отметить то обстоятельство что курорты расположены в высокогорье, в живописных урочищах которые в любое время года радуют глаз своей красотой. Не далеко от здравниц, находится город Каракол, в котором можно ознакомиться с его достопримечательностями, и посетить другой одноименный  с городом курорт, Каракол.